Modelación de la actividad clastogénica y acoplamiento molecular en los sitios de unión del HIF-1α-ADN de 3-arilcumarinas
Palavras-chave:
factor inducido por hipoxia-1; 3-arilcumarinas; clastogenicidad; acoplamiento molecularResumo
El presente trabajo analiza el potencial de las 3-arilcumarinas para causar daño al ADN e interferir con la interacción entre el factor inducido por la hipoxia-1α (HIF-1α) y ARNT para el
bloqueo de la formación de heterodímeros. El potencial clastogénico de 33 cumarinas se determinó con el programa ModesLab 2.0 y su afinidad de unión a HIF-1α:ARNT se modeló con el software MOE 2019.01. Los resultados mostraron que 14 de las cumarinas poseen potencial clastogénico, clasificación estructural modelada a partir de 10 series relacionadas con el patrón de sustitución. El estudio concluyó que la capacidad de causar una alta clastogenicidad está relacionada con la presencia de grupos metoxilo y nitro en número y posiciones específicas en la nueva estructura Anti-HIF-1 de las 3-arilcumarinas, las que mostraron en su totalidad capacidad de unión al ADN.
Referências
LERDA, D.; GARGANTINI, P. “Cáncer de pulmón y arsénico”. Revista Methodo. 2022,
(4), 329-338. https://doi.org/10.22529/me.2022.7(4)08
SEMENZA, G.L. “Defining the role of hypoxia-inducible factor 1 in cáncer biology and
therapeutics”. Oncogene. 2010, 29(5), 625-634. doi: 10.1038/onc.2009.441.
SEMENZA, G.L. “Oxygen sensing, homeostasis, and disease”. The New England Journal
of Medicine. 2011, 365(6), 537-547. doi: 10.1056/NEJMra1011165.
KAELIN, W.G.; RATCLIFFE, P.J.; SEMENZA, G.L. “Pathways for Oxygen Regulation
and Homeostasis”. Journal of the American Medical Association. 2016, 316(12), 1252–
doi:10.1001/jama.2016.12386
HU, Y.; LIU, J.; HUANG, H. “Recent agents targeting HIF-1α for cáncer therapy”.
Journal of Cellular Biochemistry. 2013, 114(3), 498–509. doi:10.1002/jcb.24390
WILKINS, S.E.; ABBOUD, M.I.; HANCOCK, R.L.; SCHOFIELD, C.J. “Targeting
Protein-Protein Interactions in the HIF System”. ChemMedChem. 2016, 11(8), 773–
doi:10.1002/cmdc.201600012
SEMENZA, G.L. “The hypoxic tumor microenvironment: A driving forcé forbreast
cáncer progression”. Biochimica et Biophysica Acta. 2016, 1863(3), 382-391. doi:
1016/j.bbamcr.2015.05.036.
ZHANG, H.; QIAN, D.Z.; TAN, Y.S.; LEE, K.; GAO, P.; REN, Y.R.; REY, S.;
HAMMERS, H.; CHANG, D.; PILI, R.; DANG, C.V.; LIU, J.O.; SEMENZA,
G.L. “Digoxin and other cardiac glycosides inhibit HIF-1synthesis and block tumor
growth”. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2008, 105(50), 19579–
doi:10.1073/pnas.0809763105
RODRÍGUEZ-MORALES, I.;VALDÉS, Y.C., PROVEYER-DERICH, S. “Citostáticos:
medicamentos riesgosos”. Revista Cubana de Medicina. 2004, 43(2-3).
http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-5232004000200009&lng=es.
ISHIDATE, M. JR.; HARNOIS, M.C., SOFUNI, T. “A comparative analysis of data on
the clastogenicity of 951 chemical substances tested in mammalian cell cultures”.
Mutation Research/ Reviews in GeneticToxicology. 1988, 195(2), 151-213. doi:
1016/0165-1110(88)90023-1.
ROSALES-RIMACHE, J.A.; MALCA-NANCY, E.; ALARCÓN-JHONATAN, J.;
CHÁVEZ, M.; GONZÁLES, M.A. “Daño genotóxico en trabajadores de minería
artesanal expuestos al mercurio”. Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud
Pública. 2013, 30(4): 595-600. http://www.scielo.org.pe/scielo.php?script=sci_arttext&
pid=S1726-46342013000400009&lng=es.
MATHEUS-LOBO T.; BOLAÑOS, A. ¨Micronúcleos: biomarcador de genotoxicidad en
expuestos a plaguicidas”. Salus. 2014, 18(2), 18-26. http://ve.scielo.org/scielo.php?script=
sci_arttext&pid=S131671382014000200005&lng=es. ISSN 1316-7138.
GONZÁLES-DÍAZ, H.; GIA, O.; URIARTE, E.; HERNÁDEZ, I.; RAMOS, R.;
CHAVIANO, M.; SEIJO, S.; CASTILLO, J.A.; MORALES, L.; SANTANA, L.;
AKPALOO, D.; MOLINA, E.; CRUZ M.; TORRES, L.A.; CABRERA,
M.A. “Markovian chemicals in silico design (MARCH-INSIDE), a promising approach
for computer-aided molecular design I: discovery of anticáncer compounds”. Journal of
Molecular Modeling. 2003, 9(6), 395–407. doi:10.1007/s00894-003-0148-7
ESTRADA, E; MOLINA, E. “Automatic extraction of structural alerts for predicting
chromosome aberrations of organic compounds”. Journal of Molecular Graphics and
Modelling. 2006, 25(3), 275–288. doi: 10.1016/j.jmgm.2006.01.002.
GUARDADO-YORDI, E.; MOLINA-PÉREZ, E.; MATOS M.J.; URIARTE-VILLARES,
E. “StructuralAlerts for Predicting Clastogenic Activity of Pro-oxidant Flavonoid
Compounds: Quantitative Structure–Activity Relationship Study”. Journal of
Biomolecular Screening. 2012, 17(2), 216–224. doi:10.1177/1087057111421623
GUARDADO-YORDI, E.; MATOS, M.J.; PÉREZ-MARTÍNEZ, A.; TORNES, C.;
SANTANA, L.; MOLINA-PÉREZ, E.; URIARTE, E. “In silico genotoxicity of coumarins: application of Phenol-Explorer Food data base to functional Food science”.
Food&Function. 2017, 8(8), 2958-2966. doi:10.1039/C7FO00402H.
GUARDADO-YORDI, E.; MATOS, M. J.; SANTANA, L.; URIARTE E.; ABREU, O. y
MOLINA-PÉREZ, E. “Natural coumarins: QSTR approaches regarding their
genotoxicity”. Journal of Biological and Chemical Research. 2015, 2015, 241-257.
doi:10.3390/ecsoc-21-04821
VANGONE, A.; SPINELLI, R.; SCARANO, V.; CAVALLO, L.; OLIVA, R.
“COCOMAPS: a web applicationtoanalyze and visualizecontacts at the interface of
biomolecular complexes”. Bioinformatics. 2011, 27(20), 2915–2916. doi:
1093/bioinformatics/btr484.
KORTEMME, T.; BAKER, D. A. “Simple physical model for binding energy hot spots in
protein-protein. complexes”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the
United States of America. 2002, 99(22), 14116-14121. doi: 10.1073/pnas.202485799.
KORTEMME, T.; KIM, D.E.; BAKER, D. “Computational alanine scanning of protein-
protein interfaces”. Science's signal transduction knowledge environment. 2004,
(219), pl2. doi: 10.1126/stke.2192004pl2.
MOLINA, E.; CASTAÑEDO, N.; URIARTE, E.; PATLEWICS, G.; HERNÁNDEZ, M.
“Estudio de la actividad clastogénica en compuestos orgánicos a partir del uso de una
herramienta bioinformática: alertas estructurales y posibles mecanismos de acción”.
Revista Cubana de Química. 2005, XVII(2), 199. ISSN: 2224-5421.
SINGH, S.K.; DAS, A. “The n → π* interaction: a rapidly emerging non-covalent
interaction”. PhysicalChemistry Chemical Physics. 2015, 17(15), 9596-9612.
doi:10.1039/C4CP05536E
WANG, T.; PENG, T.; WEN, X.; WANG, G.; SUN, Y.; LIU, S.; ZHANG, S.; WANG, L.
“Design, Synthesis and Preliminary Biological Evaluation of Benzyl-sulfone Coumarin
Derivatives as Anti-Cancer Agents”. Molecules. 2019, 24, 4034. doi:
3390/molecules24224034
MOLINA-PÉREZ, E.; CASTAÑEDO-CANCIO, N.; URIARTE-VILLARES, E. “Síntesis
de nuevas benzofurocumarinas con acción antitumoral”. Revista Cubana de Química.
, XVII(3), 180-186. https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=443543687071
BONARDI, A.; FALSINI, M.; CATARZI, D.; VARANO, F.; DI CESARE MANNELLI,
L.; TENCI, B.; GHELARDINI, C.; ANGELI, A.; SUPURAN, C.T.; COLOTTA, V.
“Structural investigations on coumarins leading to chromeno[4,3-c]pyrazol-4-ones and
pyrano[4,3-c]pyrazol-4-ones: New scaffolds for the design of the tumor-associated
carbonican hydrase isoforms IX and XII”. European Journal of Medicinal Chemistry.
, 146, 47-59. doi:10.1016/j.ejmech.2018.01.033
Downloads
Publicado
Como Citar
Edição
Seção
Licença
Copyright (c) 2024 Oscar Guillermo Collado-García, Liyoesmin Salinas-Rojas, Humberto J. Morris-Quevedo, Hans De Winter, Enrique Molina-Pérez
Este trabalho está licenciado sob uma licença Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
Esta revista oferece acesso aberto imediato ao seu conteúdo, com base no princípio de que oferecer ao público o acesso gratuito à pesquisa contribui para uma maior troca global de conhecimento.