Modelación por homología de la tirosinasa hipotética en pleurotus ostreatus PC15
Palabras clave:
homología estructural; diagrama de Ramachandran; oscurecimiento enzimático; in silico.Resumen
La enzima tirosinasa se relaciona con el oscurecimiento enzimático de los hongos, considerándose la causa principal de la disminución de su valor comercial. Se seleccionó como plantilla la estructura 4j3p A de Aspergillus oryzae, por su similitud con la secuencia de la proteína de Pleurotus ostreatus PC15. Los modelos fueron construidos utilizando los servidores Swiss-model, I-TASSER y Phyre2 y validados por medio del diagrama de Ramachandran suministrado por Procheck, los servidores Verify3D y ProSA. Se obtuvieron tres modelos tridimensionales para la enzima tirosinasa hipotética de Pleurotus ostreatus PC15 validados por diferentes estrategias computacionales. El modelo Tyr Swiss resultó el mejor con un 85,5 % de los residuos de aminoácidos bajo la región favorecida, y un z-score de -7,15 en ProSA. El valor de Verify 3D de 80,73 % indicó que el entorno del perfil del modelo es apropiado. Los modelos obtenidos podrían ser útiles para la búsqueda de nuevos inhibidores de la enzima con aplicaciones industriales.
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