Modelación por homología de la tirosinasa hipotética en pleurotus ostreatus PC15

Autores

  • Ianna Y. Benavides-Oro Departamento de Biología y Geografía, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba
  • Javier Peña-López Departamento de Biología y Geografía, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba
  • Lisandra M. Cutiño-Viñals Departamento de Biología y Geografía, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba
  • Armando Contreras-Quesada Departamento de Biología y Geografía, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba
  • Humberto J. Morris-Quevedo Centro de Estudios de Biotecnología Industrial, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad de Oriente, Santiago de Cuba, Cuba

Palavras-chave:

homología estructural; diagrama de Ramachandran; oscurecimiento enzimático; in silico.

Resumo

La enzima tirosinasa se relaciona con el oscurecimiento enzimático de los hongos, considerándose la causa principal de la disminución de su valor comercial. Se seleccionó como plantilla la estructura 4j3p A de Aspergillus oryzae, por su similitud con la secuencia de la proteína de Pleurotus ostreatus PC15. Los modelos fueron construidos utilizando los servidores Swiss-model, I-TASSER y Phyre2 y validados por medio del diagrama de Ramachandran suministrado por Procheck, los servidores Verify3D y ProSA. Se obtuvieron tres modelos tridimensionales para la enzima tirosinasa hipotética de Pleurotus ostreatus PC15 validados por diferentes estrategias computacionales. El modelo Tyr Swiss resultó el mejor con un 85,5 % de los residuos de aminoácidos bajo la región favorecida, y un z-score de -7,15 en ProSA. El valor de Verify 3D de 80,73 % indicó que el entorno del perfil del modelo es apropiado. Los modelos obtenidos podrían ser útiles para la búsqueda de nuevos inhibidores de la enzima con aplicaciones industriales.

Publicado

2020-09-29

Como Citar

Benavides-Oro, I. Y., Peña-López, J., Cutiño-Viñals, L. M., Contreras-Quesada, A., & Morris-Quevedo, H. J. (2020). Modelación por homología de la tirosinasa hipotética en pleurotus ostreatus PC15. Revista Cubana De Química, 32(2), 172–194. Recuperado de https://cubanaquimica.uo.edu.cu/index.php/cq/article/view/5134

Edição

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