Obtención de modelos de relación cuantitativa estructura actividad (QSAR) para la predicción de actividad antibacteriana en series heterogéneas de compuestos
Resumen
Se obtuvieron dos modelos discriminantes para la predicción de la actividad antibacteriana. El modelo 1 se obtuvo empleando descriptores TOPS-MODE y de fragmentos, el modelo 2 con descriptores 3D y de fragmentos, usando el Análisis Discriminante Lineal. El estudio se realizó con 402 compuestos reportados en la literatura. El modelo 1 clasificó el 90 % de casos activos y el 97 y 93 % de casos inactivos en las series de entrenamiento y predicción respectivamente, con una clasificación global de 93 y 91 %. El modelo 2 clasificó el 89 y 90 % de casos activos y el 95 y 91 % de casos inactivos en las series de entrenamiento y predicción respectivamente, con una clasificación global de 92 y 89 %. Estos resultados y los valores de los índices estadísticos de los modelos permitieron demostrar sus calidades. Además, fueron calculadas las contribuciones de los fragmentos a la actividad antibacteriana para ambos modelos.
Palabras clave: QSAR, antibacteriana, TOPS-MODE, descriptores 3D, LDA.
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